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如何快速測量細(xì)胞劃痕寬度？

發(fā)布時間： 2021-12-22　　點擊次數(shù)： 1782次

細(xì)胞劃痕實驗可謂是性價比高的一個小實驗了?？梢栽诓活~外購買實驗設(shè)備的情況下，一定程度地評價腫瘤細(xì)胞或者成纖維細(xì)胞的遷移能力。

在課題組經(jīng)費的限制下，這個實驗成為很多老板的*。

細(xì)胞劃痕實驗本身的操作很簡單，網(wǎng)上有很多教程，此處不贅述。當(dāng)你辛辛苦苦拿到了下面這張照片時，說明你已經(jīng)成功了一大半。

接下來的工作就是測量，本文將以此為例，寫出測量的圖文教程。

1. 下載并安裝Image Pro Plus。

2. 點擊File→Open，打開你需要測量的圖片。

3. 增強(qiáng)細(xì)胞劃痕邊界的信號，以提高IPP識別準(zhǔn)確度。點擊Process，點擊過濾器Filters。

4. 在Filters彈窗中，依次選擇以下參數(shù)，需要做3步。

（4.1）在Edge選項下，選擇Sobel。然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口，將細(xì)胞劃痕的邊緣拖到這個窗口處，意在增強(qiáng)這個邊界。

點擊Apply之后，可以看到目標(biāo)圖片已經(jīng)發(fā)生改變，邊界更加清晰了。

（4.2）在Morphological選項下，選擇Close。然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口，使得細(xì)胞占滿這個窗口。此步意在通過算法將細(xì)胞區(qū)域中的空隙都填充上顏色，以提高IPP的自動識別準(zhǔn)確度。

點擊Apply之后，可以看到目標(biāo)圖片再次發(fā)生改變。

（4.3）在Enhancement選項下，選擇Lopass，選擇5X5，然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口，使得劃痕邊界處在這個窗口。此步驟意在調(diào)整劃痕邊界的平滑度。

點擊Apply之后，可以看到目標(biāo)圖片又一次發(fā)生改變。

5. 增強(qiáng)圖片的對比度。

（5.1）點擊Enhance，選擇Contrast Enhancement，調(diào)出下面的設(shè)置界面彈窗。

（5.2）拉動圖中的曲線，以獲取合適的對比度。（當(dāng)然你也可以點擊彈窗中Save選項，保存這個對比度文件。后面測量其它圖片時，到了這一步可以點擊Load調(diào)出設(shè)置文件。這種操作更有利于減小測量誤差。）

6. 點擊矩形工具，將圖中的細(xì)胞寬度框選。如下圖。

7. 點擊Measure中的count/size選項，彈框中點擊measrue，再點擊select measurement。測量參數(shù)選擇Area和Box Height。調(diào)整Area最小測量值為1000，以便于過濾小面積區(qū)域。（注意：如果你的細(xì)胞劃痕圖像是橫著的，那就要選擇Box width）。點擊OK。

8. 最關(guān)鍵的一步。在manual模式下，點擊select colors，進(jìn)入選色界面。在HSI模式下通過調(diào)整0-255數(shù)值或拉動圖中曲線，保證我們畫的矩形選框中盡可能的被填滿紅色。

同樣的，你可以點擊彈窗中的File按鈕來保存你的設(shè)置文件，測量其它圖片時之間調(diào)用，以減小測量誤差。完成后點擊close。

9. 在count/size界面選擇Option，然后按照下圖進(jìn)行設(shè)置。最關(guān)鍵的是選擇filled。完成后點擊OK。

10. 點擊count，可以看到劃痕區(qū)域被選擇為多個測量區(qū)域，且存在一個最大測量區(qū)域被紅色全部充滿。這樣的測量才是符合的。

11. 點擊View，查看數(shù)據(jù)。其中最大面積及其對應(yīng)的高度值就是我們需要的數(shù)據(jù)。

12. 細(xì)胞劃痕寬度

細(xì)胞劃痕平均寬度=細(xì)胞劃痕最大測量面積 / 對應(yīng)的長度

（eg，本例中細(xì)胞劃痕最大的測量面積是1954623，對應(yīng)長度為2531，那么細(xì)胞劃痕平均寬度就是772.3）

13. 測量單位的問題

首先，你的所有圖片應(yīng)該是在同一倍數(shù)的鏡下拍攝，一般10X。此時你采用IPP測量的寬度數(shù)值單位是“像素"，如果是多組間的比較，是否有單位對于組間比較無影響。

至于這個像素所代表的實際尺寸，則必須在該顯微鏡10X倍數(shù)下重新拍攝一個標(biāo)尺，然后使用這個標(biāo)尺進(jìn)行像素與尺寸的換算，最終得到細(xì)胞劃寬度的實際尺寸。

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